他们之间的区别就是，玉髓是介于翡翠和玛瑙之间的一种宝石，它不是水晶。玉髓色泽柔和温润，可以调节一个人的心境，帮助主人平心静气，对人体的视觉系统有很好的调节作用，同时具备聚财的功能，呵呵，玉髓包括蓝玉髓、紫玉髓、粉玉髓、白玉髓、红玉髓等。
玉髓是一种矿物，又名“石髓” ，玉髓其实是一种石英，SiO₂的隐晶质体的统称，它是石英(隐晶质)的变种。它以乳房状或钟乳状产出，常呈肾状、钟乳状、葡萄状等，具有蜡质光。玉髓形成于低温和低压条件下，出现在喷出岩的空洞、热液脉、温泉沉积物、碎屑沉积物及风化壳中。有的玉髓结核内会含有水和气泡，非常有趣。它的物理性质与石英一样。玉髓被人们当作宝石，主要用作首饰和工艺美术品的材料。玉髓与人们熟知的玛瑙是同种矿物。有条带状构造的隐晶质石英就是玛瑙，没有条带状构造、颜色均一的隐晶质石英就是玉髓。
水晶(rock crystal)，稀有矿物，宝石的一种，石英结晶体，在矿物学上属于石英族，主要化学成份是二氧化硅，化学式为SiO2，纯净时形成无色透明的晶体，当含微量元素Al、Fe等时呈紫色、黄色、茶色等，经辐照微量元素形成不同类型的色心，产生不同的颜色，如紫色、黄色、茶色、粉色等。含伴生包裹体矿物的被称之为包裹体水晶，如发晶、绿幽灵等，内包物为金红石、电气石、阳起石、云母、绿泥石等。